Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpb1B2RS76 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms