Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms