Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV5

Gm13119, Predicted gene 13119, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13119B1ARV5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm13119B1ARV5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm13119B1ARV5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm13119B1ARV5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm13119B1ARV5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm13119B1ARV5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm13119B1ARV5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm13119B1ARV5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm13119B1ARV5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm13119B1ARV5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm13119B1ARV5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms