Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms