Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Homer1Q9Z2Y3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Homer1Q9Z2Y3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Homer1Q9Z2Y3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Homer1Q9Z2Y3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms