Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gria4Q9Z2W8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gria4Q9Z2W8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gria4Q9Z2W8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms