Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms