Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd4Q9Z2D7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd4Q9Z2D7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd4Q9Z2D7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd4Q9Z2D7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mbd4Q9Z2D7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 823.3 ms