Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdpk1Q9Z2A0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdpk1Q9Z2A0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdpk1Q9Z2A0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms