Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdf15Q9Z0J7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf15Q9Z0J7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf15Q9Z0J7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf15Q9Z0J7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms