Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin2Q9WVE8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacsin2Q9WVE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms