Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZV9

Nxt1, NTF2-related export protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxt1Q9QZV9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nxt1Q9QZV9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nxt1Q9QZV9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxt1Q9QZV9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxt1Q9QZV9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxt1Q9QZV9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxt1Q9QZV9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxt1Q9QZV9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxt1Q9QZV9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxt1Q9QZV9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxt1Q9QZV9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxt1Q9QZV9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxt1Q9QZV9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxt1Q9QZV9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxt1Q9QZV9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxt1Q9QZV9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms