Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp21Q9QZL6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp21Q9QZL6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp21Q9QZL6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp21Q9QZL6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp21Q9QZL6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp21Q9QZL6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp21Q9QZL6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms