Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr4a3Q9QZB6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr4a3Q9QZB6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr4a3Q9QZB6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr4a3Q9QZB6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 918.7 ms