Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Six6Q9QZ28 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Six6Q9QZ28 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms