Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hacd1Q9QY80 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hacd1Q9QY80 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms