Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcb11Q9QY30 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcb11Q9QY30 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcb11Q9QY30 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb11Q9QY30 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms