Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim44Q9QXA7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim44Q9QXA7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim44Q9QXA7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms