Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc4Q9QUQ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc4Q9QUQ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc4Q9QUQ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc4Q9QUQ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms