Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhoaQ9QUI0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RhoaQ9QUI0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhoaQ9QUI0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RhoaQ9QUI0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms