Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmub1Q9JMG3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmub1Q9JMG3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmub1Q9JMG3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmub1Q9JMG3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmub1Q9JMG3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmub1Q9JMG3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms