Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Aldh9a1Q9JLJ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Aldh9a1Q9JLJ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms