Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl39Q9JKF7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl39Q9JKF7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mrpl39Q9JKF7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms