Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scamp5Q9JKD3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scamp5Q9JKD3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scamp5Q9JKD3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scamp5Q9JKD3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scamp5Q9JKD3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms