Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ascl3Q9JJR7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ascl3Q9JJR7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ascl3Q9JJR7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ascl3Q9JJR7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ascl3Q9JJR7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ascl3Q9JJR7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ascl3Q9JJR7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ascl3Q9JJR7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ascl3Q9JJR7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ascl3Q9JJR7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ascl3Q9JJR7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ascl3Q9JJR7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms