Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Oxct2aQ9JJN4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Oxct2aQ9JJN4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Oxct2aQ9JJN4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms