Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx21Q9JIK5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx21Q9JIK5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx21Q9JIK5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx21Q9JIK5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx21Q9JIK5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx21Q9JIK5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx21Q9JIK5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx21Q9JIK5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx21Q9JIK5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx21Q9JIK5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx21Q9JIK5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.7 ms