Protein–RNA interactions for Protein: Q9JII6

Akr1a1, Alcohol dehydrogenase [NADP(+)], mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akr1a1Q9JII6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akr1a1Q9JII6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Akr1a1Q9JII6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Akr1a1Q9JII6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Akr1a1Q9JII6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Akr1a1Q9JII6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms