Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpcn1Q9EQJ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpcn1Q9EQJ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpcn1Q9EQJ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpcn1Q9EQJ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
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