Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trpv4Q9EPK8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpv4Q9EPK8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv4Q9EPK8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms