Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3s1Q9DCR2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap3s1Q9DCR2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap3s1Q9DCR2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms