Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCM4

Dnal4, Dynein light chain 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal4Q9DCM4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnal4Q9DCM4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnal4Q9DCM4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal4Q9DCM4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms