Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ1

Mlst8, Target of rapamycin complex subunit LST8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlst8Q9DCJ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mlst8Q9DCJ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mlst8Q9DCJ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mlst8Q9DCJ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mlst8Q9DCJ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mlst8Q9DCJ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mlst8Q9DCJ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mlst8Q9DCJ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mlst8Q9DCJ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mlst8Q9DCJ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mlst8Q9DCJ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms