Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Swt1Q9DBQ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Swt1Q9DBQ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Swt1Q9DBQ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Swt1Q9DBQ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Swt1Q9DBQ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Swt1Q9DBQ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Swt1Q9DBQ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Swt1Q9DBQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Swt1Q9DBQ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Swt1Q9DBQ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Swt1Q9DBQ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Swt1Q9DBQ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms