Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf4Q9DAW6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf4Q9DAW6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf4Q9DAW6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms