Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Cmtm2aQ9DAR1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Cmtm2aQ9DAR1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Cmtm2aQ9DAR1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19,87■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,86■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,4 ms