Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cmtm2bQ9DAC0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2bQ9DAC0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms