Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q9DAA3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DAA3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DAA3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DAA3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DAA3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DAA3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9DAA3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DAA3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DAA3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DAA3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DAA3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DAA3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DAA3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DAA3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DAA3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DAA3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DAA3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DAA3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DAA3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DAA3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DAA3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms