Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc89Q9DA73 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc89Q9DA73 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc89Q9DA73 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc89Q9DA73 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc89Q9DA73 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc89Q9DA73 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc89Q9DA73 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc89Q9DA73 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc89Q9DA73 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc89Q9DA73 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms