Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph9Q9D9V4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph9Q9D9V4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph9Q9D9V4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph9Q9D9V4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph9Q9D9V4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph9Q9D9V4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph9Q9D9V4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph9Q9D9V4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph9Q9D9V4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms