Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf2Q9D8U4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf2Q9D8U4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf2Q9D8U4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf2Q9D8U4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf2Q9D8U4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms