Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3a3Q9D554 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3a3Q9D554 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3a3Q9D554 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms