Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms