Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam90a1bQ9D4F3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam90a1bQ9D4F3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam90a1bQ9D4F3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms