Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Clvs1Q9D4C9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clvs1Q9D4C9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clvs1Q9D4C9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clvs1Q9D4C9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clvs1Q9D4C9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clvs1Q9D4C9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms