Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4933436I01RikQ9D3T1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933436I01RikQ9D3T1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933436I01RikQ9D3T1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933436I01RikQ9D3T1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933436I01RikQ9D3T1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933436I01RikQ9D3T1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933436I01RikQ9D3T1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933436I01RikQ9D3T1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933436I01RikQ9D3T1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933436I01RikQ9D3T1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933436I01RikQ9D3T1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms