Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3I0

5530400C23Rik, RIKEN cDNA 5530400C23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5530400C23RikQ9D3I0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
5530400C23RikQ9D3I0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
5530400C23RikQ9D3I0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
5530400C23RikQ9D3I0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
5530400C23RikQ9D3I0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
5530400C23RikQ9D3I0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
5530400C23RikQ9D3I0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
5530400C23RikQ9D3I0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
5530400C23RikQ9D3I0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5530400C23RikQ9D3I0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5530400C23RikQ9D3I0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
5530400C23RikQ9D3I0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
5530400C23RikQ9D3I0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
5530400C23RikQ9D3I0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
5530400C23RikQ9D3I0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
5530400C23RikQ9D3I0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
5530400C23RikQ9D3I0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5530400C23RikQ9D3I0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184 ms