Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt20Q9D312 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt20Q9D312 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt20Q9D312 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt20Q9D312 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms