Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisal2bQ9D1Y9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal2bQ9D1Y9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shisal2bQ9D1Y9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms