Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lingo1Q9D1T0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lingo1Q9D1T0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lingo1Q9D1T0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lingo1Q9D1T0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lingo1Q9D1T0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lingo1Q9D1T0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo1Q9D1T0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo1Q9D1T0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lingo1Q9D1T0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lingo1Q9D1T0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lingo1Q9D1T0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lingo1Q9D1T0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms